Демонстрируется невозможность использования традиционных стохастических методов в оценке пара-метров сложных биосистем – complexity. Их амплитудно-частотные характеристики (АЧХ), автокорреляционные функции A(t), экспоненты Ляпунова, статистические функции распределения f(x) непрерывно изменяются. На фоне такой хаотической динамики параметров треморограмм, кардиограмм, теппинграмм, миограмм и др. параметров гомеостаза можно наблюдать некоторую упорядоченность в динамике этих процессов. Эта упорядоченность проявляется в изменениях числа пар совпадений выборок, которые получаются при измерениях указанных процессов. Поскольку все стохастические характеристики непрерывно изменяются, то предлагается использовать расчет статистических функций распределения при повторах серий одинаковых экспериментов. В этом случае число совпадений пар выборок (возможности их отнесения к одной генеральной совокупности) будет количественно представлять механизм перехода от хаоса к порядку или изменения доли хаоса в организации движений и биоэлектрической активности мышц. Демонстрируется ряд характерных примеров из области сравнения матриц парного сравнения при различных физиологических состояниях организма обследуемых испытуемых.