Приведена гидробиологическая характеристика экотонных сообществ зоопланктона устьевой области малого притока равнинного водохранилища. С позиции теории хаоса–самоорганизации обсуждается синэкологическая динамика, нарушение гомеостаза, активация буферной системы экотона и срыв адаптации контурных сообществ зоопланктона маргинальных структур переходных зон системы «речные–водохранилищные воды» притока Рыбинского водохранилища в условиях изменений средовых факторов.